home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00356 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.6 KB  |  59 lines
  1. ******************************
  2. * Insect defensins signature *
  3. ******************************
  4.  
  5. Insect defensins   are  a  family  of  cysteine-rich  antibacterial  peptides,
  6. primarily active  against gram-positive bacteria. The peptides known to belong
  7. to this family are listed below.
  8.  
  9.  - Phormicin A and B from black blowfly (Phormia terranovae) [1].
  10.  - Royalisin from the royal jelly of honey bee [2].
  11.  - Sapecin and sapecin C from flesh fly (Sarcophaga peregrina) [3].
  12.  - Antibacterial peptides B and C from the beetle Zophobas atratus [4].
  13.  - Defensin from the larva of the dragonfly Aeschna cyanea [5].
  14.  
  15. All  these  peptides range in length from 38 to 51 amino acids.  There are six
  16. conserved cysteines all  involved  in intrachain disulfide bonds.  A schematic
  17. representation of peptides from the insect defensin family is shown below.
  18.  
  19.             +----------------------------+
  20.             |              **************|********
  21.           xxCxxxxxxxxxxxxxxCxxxCxxxxxxxxxCxxxxxCxCxx
  22.                            |   |               | |
  23.                            +---|---------------+ |
  24.                                +-----------------+
  25.  
  26. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  27. '*': position of the pattern.
  28.  
  29. -Consensus pattern: C-x(3)-C-x(3,4)-G-x(2)-G-G-x-C-x(1,4)-K-x(2)-C-x-C
  30.                     [The five C's are involved in disulfide bonds]
  31. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  32. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  33.  
  34. -Note: although  low  level  sequence  similarities  have  been  reported  [1]
  35.  between insect defensins and mammalian defensins, the topological arrangement
  36.  of the disulfide  bonds  as well as the tertiary structure [6] are completely
  37.  different in the two families.
  38.  
  39. -Last update: October 1993 / Text revised.
  40.  
  41. [ 1] Lambert J., Keppi E., Dimarcq J.-L., Wicker C., Reichhart J.-M.,
  42.      Dunbar B., Lepage P., van Dorsselaer A., Hoffmann J., Fothergill J.,
  43.      Hoffmann D.
  44.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86:262-266(1989).
  45. [ 2] Fujiwara S., Imai J., Fujiwara M., Yaeshima T., Kawashima T.,
  46.      Kobayashi K.
  47.      J. Biol. Chem. 265:11333-11337(1990).
  48. [ 3] Yamada K., Natori S.
  49.      Biochem. J. 291:275-279(1993).
  50. [ 4] Bulet P., Cociancich S., Dimarcq J.-L., Lambert J., Reichhart J.-M.,
  51.      Hoffmann D., Hetru C., Hoffmann J.A.
  52.      J. Biol. Chem. 266:24520-24525(1991).
  53. [ 5] Bulet P., Cociancich S., Reuland M., Sauber F., Bischoff R., Hegy G.,
  54.      van Dorsselaer A., Hetru C., Hoffmann J.A.
  55.      Eur. J. Biochem. 209:977-984(1992).
  56. [ 6] Hanzawa H., Shimada I., Kuzuhara T., Komano H., Kohda D., Inagaki F.,
  57.      Natori S., Arata Y.
  58.      FEBS Lett. 269:413-420(1990).
  59.